logo

Nieuwsbrief

De vereniging voor iedereen in Nederland die bezig is met of geinteresseerd is in Grid computing

Activiteiten
OGF nieuws
Cursussen en evenementen
Ledennieuws
Jobcorner

Gridforum Nederland

redactie@gridforum.nl

Nummer april 2013
Cursussen en evenementen
29 maart 2013
25 april 2013 - InnovateIT 2013 over nieuwe benadering tot cloud computing in Amsterdam ⇒
De vierde editie van Innovate IT vindt plaats in het Dutch Design Hotel Artemis in Amsterdam op 25 april 2013. Na 3 succesvolle edities van de Innovate IT Conference is het tijd om nieuwe manieren te presenteren om business mogelijk te maken middels cloud computing. Innovate IT 2013 richt zich op de business van cloud computing en geeft een overzicht van voorbeelden, 'lessons learned', integratie opties en methodologieen. Deze editie staan befaamde business cases centraal. Bezoekers leren van organisaties die de omkeer naar cloud computing hebben gemaakt en krijgen tips en handvatten om toe te passen in hun eigen organisatie.
18 april 2013
6-7 mei en 28-29 mei 2013 - Inleidende cursussen voor Cartesius in Amsterdam ⇒

SURFsara heeft enkele twee-daagse cursussen gepland voor een inleiding op de nieuwe nationale supercomputer Cartesius. De cursussen vinden plaats respectievelijk op 6-7 mei en 28-29 mei 2013, telkens in de Eulerzaal aan het Science Park 125 in Amsterdam, vanaf 10u00. Het programma voorziet: overzicht van het systeem met compute nodes, netwerk, filesystemen; beschikbare softwarepakketten en libraries; programma samenstellen met de Intel compiler; gebruik van de Intel MPI library; gebruik van de Bullx MPI library; batch jobs schrijven; beschikbare tools voor profiling en debugging.

08 april 2013
15 mei 2013 - De uitdaging van het delen van medische onderzoeksdata deel 3 in Utrecht ⇒
Hoe kun je medische onderzoeksdata zo veilig en efficient mogelijk uitwisselen? Rondom dit thema organiseert SURFacademy een aantal seminars. Op 15 mei 2013 is het derde seminar in Utrecht. Iedere dag worden binnen ziekenhuizen grote hoeveelheden digitale data gegenereerd, niet alleen patientendata, maar juist ook data bestemd voor onderzoek. Deze data worden steeds meer gedeeld, zowel binnen het eigen instituut, als instellingsoverstijgend. Voor academische en STZ-ziekenhuizen is het belangrijk, dat hun netwerkinfrastructuur deze grote hoeveelheden medische onderzoeksdata aankan. Niet alleen de capaciteit en snelheid van het netwerk zijn belangrijk, maar ook de beveiliging en communicatie met andere netwerken spelen een grote rol. Tijdens dit derde seminar op 15 mei zullen presentaties gegeven worden rondom de thema's infrastructuren, pseudonimisatie en data-ontsluiting. Dit seminar richt zich zowel op onderzoekers die medische onderzoeksdata uitwisselen, als op netwerkbeheerders en beveiligingsspecialisten bij UMC's en STZ-ziekenhuizen. Het vindt plaats bij SURFnet en is gratis voor aangesloten instellingen.
16 april 2013
22-23 mei 2013 - e-IRG Open Workshop in Dublin, Ierland ⇒
De e-IRG Open Workshop zal plaatsvinden in het Trinity Biomedical Sciences Institute. Belangrijke onderwerpen met betrekking tot het op een lijn brengen van de Europese Unie met nationale benaderingen tot e-Infrastructuren staan op de agenda, zoals Open Access van gegevens en Europese data services. Er worden drie tracks georganiseerd. De eerste gaat over e-Infrastructuur coordinatie en behandelt de implementatie van ERA, de coordinatie van e-Infrastructuur initiatieven en de e-IRG White Paper 2013. De tweede snijdt het hoofdstuk van wettelijke interoperabiliteit aan met Open Access en de verwachtingen, realiteit, hindernissen hieromtrent en hoe de obstakels uit de weg kunnen geruimd worden in een internationale contekst van samenwerking. De derde track gaat over interoperabiliteit van gegevens en diensten met grensoverschrijdende data services in Europa. Keynote sprekers zullen de tracks inleiden die verder uitgewerkt zullen worden in breakout sessies waarin deelnemers de kans krijgen om uitgebreid over de onderwerpen te discussieren. Een panel van experten zal spreken over de toekomstige richting van het gegevensbeleid met extra belichting van de rol van de Research Data Alliance hierin.
09 april 2013
13 juni 2013 - 1ste ConPaaS Workshop in Amsterdam ⇒
Op donderdag 13 juni 2013 vindt in Amsterdam de eerste ConPaaS Workshop plaats. ConPaaS groeit constant met nieuwe mogelijkheden en uitbreidingen om de paar weken. De ConPaaS workshop biedt een forum voor ConPaaS ontwikkelaars en gebruikers om elkaar te ontmoeten, recente ontwikkelingen te leren kennen, en de gelegenheid te krijgen om invloed te hebben op de roadmap voor de volgende versies. De volgende onderwerpen komen zeker aan bod: de huidige staat van ontwikkeling en de korte termijn plannen voor uitbreidingen; technische presentaties over de interne systeemarchitectuur; tutorials over het uitbreiden van ConPaaS en het opbouwen van nieuwe services; verhalen van tevreden gebruikers; onderzoeksresultaten mogelijk dankzij ConPaaS; toekomstige onderzoeksplannen met ConPaaS en het nieuwe Harness EU project; exploitatieplannen voor ConPaaS.
16 april 2013
8-12-juli 2013 - Programming en tUning Massively Parallel Systems Summer School in Barcelona, Spanje ⇒

Het Barcelona Supercomputing Center is de gastheer voor de vierde editie van de PUMPS Zomerschool die plaatsvindt van 8 tot en met 12 juli 2013 in Barcelona, Spanje. PUMPS 2013 biedt onderzoekers en studenten een unieke gelegenheid om hun vaardigheden met de nieuwste technieken te verbeteren en praktische ervaring op te doen bij het ontwikkelen en afstellen van toepassingen voor many-core processoren met massief parallelle computer resources zoals GPU acceleratoren. De docenten zijn Wen-mei Hwu, van de Universiteit van Illinois in Urbana-Champaign; David Kirk, NVIDIA Fellow, voormalig hoofdonderzoeker, NVIDIA Corporation; en Isaac Gelado, Rosa Badia, Xavier Martorell, Nacho Navarro van BSC en de Polytechnische Universiteit van Catalonie. De zomerschool is gericht op vooruitstrevende programmeertechnologie en daarom is ervaring in de basis van GPGPU programmeren een troef bij het selectieproces. Kandidaturen worden ingewacht tot 17 mei 2013.

17 april 2013
22-26 juli 2013 - Cloud Computing Zomerschool in Almere ⇒
Tussen 22 en 26 juli 2013 organaniseert Genias met de steun van het Contrail project en in het kader van de Zomerschool Almere een vijfdaagse Cloud Computing cursus voor junior onderzoekers in computersystemen. In de cursus komen de volgende onderwerpen in detail aan bod: Cloud computing systemen en toepassingen; high-performance computing, Platform-as-a-Service, cloud federaties, Infrastructure-as-a-Service. De cursus biedt een mix van presentaties door vooraanstaande experten in Cloud technologie en praktische sessies met de nadruk op infrastructuren en systemen. Studenten doen zo ervaring op in het gebruik van de cloud en spelen een actieve rol in toekomstige ontwikkelingen ervan. De praktische sessies zijn gebaseerd op open source OpenNebula, Openstack en Contrail cloud stystemen alsmede commerciele clouds. Een dag wordt besteed aan een lokale workshop met presentaties over cloud behoeften en oplossingen in het professionele leven. Het thema van dit jaar is de Dutch Health Hub. De overige vier dagen zijn voorbehouden voor het wetenschappelijke en technische programma. Uiterste datum voor inschrijving is 21 juni 2013.
Ledennieuws
10 april 2013
Gezamenlijke Master opleiding Computational Science UvA en ITMO ⇒
Op dinsdag 9 april jongstleden zijn de handtekeningen gezet onder de overeenkomst tussen de Universiteit van Amsterdam en de ITMO Universiteit van St. Petersburg voor een gezamenlijk masterprogramma Computational Science. De samenwerking is tot stand gekomen vanuit het initiatief van Prof. Peter Sloot, die aan beide universiteiten is gelieerd. De overeenkomst is ondertekend door de voorzitter van het College van Bestuur, Prof. Louise J. Gunning-Schepers en Prof. Vladimir Vasiliev, Rector St. Petersburg National Research University of Information Technologies, Mechanics and Optics (ITMO). In de overeenkomst is een nauwe en unieke samenwerking tussen de master opleidingen Computational Science van het ITMO en van de UvA tot stand gekomen. De Russische studenten zullen een gereduceerd collegegeld tarief betalen, vanwege de toekenning van de 'Leading Scientist Research Grant' van de Russische federatie aan prof. Peter Sloot.
11 april 2013
SURFnet bezoekt zusterorganisaties CERnet en CSTnet in China ⇒
Op 8 en 9 april bezocht een delegatie van SURFnet, bestaande uit Erik Huizer, Gerben van Malenstein, Ilse Koning en Alexander van den Hil, de zusterorganisaties in China. Bij CERnet en CSTnet zijn de mogelijkheden voor een intensievere samenwerking besproken. Tijdens het bezoek in Beijing hebben CSTnet (NREN voor onderzoeksinstellingen), CERnet (NREN voor educatieve instellingen) en SURFnet elkaar geinformeerd over de laatste ontwikkelingen. Ze hebben daarbij uitgesproken meer te gaan samenwerken op het gebied van SURFconext, eduroam, OpenFlow, Open Exchanges en lichtpaden. Daarnaast zijn concrete afspraken gemaakt om de verbinding tussen Europa en China - de ORIENTplus - in te zetten om data-intensief onderzoek te ondersteunen. De behoefte hieraan wordt nu vooral kenbaar gemaakt door radioastronomie en genoomonderzoek.
17 april 2013
PRACE brengt nieuwsletter 11 uit ⇒

Het elfde nummer van de PRACE nieuwsbrief, die vier keer per jaar uitkomt, is verschenen. In dit nummer kunt u lezen over PRACE 2.0: Europa's ambities met HPC; de kracht van PRACE: verder kijken dan het standaard model; durf het onmogelijke te denken; PRACE's HPC zomer; toekomstige events; en geselecteerde nieuwtjes.

10 april 2013
ProRail selecteert CGI om bedrijfskritische verkeersregelinstallaties te ontwikkelen en te beheren ⇒
ProRail, dat het Nederlandse spoorwegnet beheert, heeft CGI geselecteerd als een van haar software beheer- en ontwikkelingspartners. CGI zal helpen om bedrijfskritische verkeersregelinstallaties van ProRail te ontwikkelen en beheren onder een zesjarige overeenkomst met een optie tot verlenging voor vier jaar. Het eerste project in het kader van de overeenkomst wordt gewaardeerd op meer dan 10 miljoen euro. ProRail heeft als opdracht ervoor te zorgen dat meer dan 6000 treinen voor passagiers en vrachtvervoer soepel rijden in Nederland. Haar verkeersregelinstallaties moeten feilloos functioneren 24 uur per dag, 7 dagen per week om 1.200.000 passagiers per dag hun bestemmingen te laten bereiken. Het beheer van deze systemen is dan ook zeer kritisch; aanpassingen moeten plaatsvinden zonder impact op business continuiteit. In de komende tien jaar zullen CGI en ProRail de focus leggen op kwaliteitsbeheer en technische ondersteuning, alsmede voortdurende innovatie. CGI heeft een langdurige relatie met ProRail, alsmede op het gebied van verkeersleiding en reisinformatiesystemen. Voorheen heeft CGI een oplossing ontwikkeld genaamd Trein Observatie & Tracking System (Trots) voor ProRail. Dit treinnummer volgsysteem biedt informatie aan verkeersleiders over de positie van de treinen. Met deze oplossing hebben verkeersleiders altijd accurate, real-time informatie voor gebruik in het leiden van het treinverkeer en het waarborgen van de veiligheid van treinreizigers.
15 april 2013
Tweede PRACE Digest editie nu beschikbaar voor download ⇒

De tweede PRACE Digest editie van 2013 is net uitgekomen. Het is een speciaal nummer dat het gebruik door de industrie belicht van de PRACE resources en toepassingen. Zo is er in deze editie aandacht voor oplossingen met betrekking tot overstromingen door overvloedige regens en betere waterdoorstroming; simulaties voor het ontwerpen van automotoren; de bouw van complexe industriele structuren; het identificeren van nieuwe toepassingen van reeds bestaande medicijnen; populaire multifysische open source simulatiesoftware; warmte-overdracht; hydrodynamische simulaties; crash test simulaties; many-core hardware; en het simuleren van aardbevingen.

17 april 2013
Groen software project ⇒
De Software and Network Engineering (SNE) groep van het Instituut voor Informatica heeft subsidie ontvangen van het Europees Fonds voor Regionale Ontwikkeling (EFRO), om te onderzoeken hoe software en hardware optimaal op elkaar kunnen worden afgestemd om data centra 'groener' te laten opereren. Het project wordt gefinancierd door EFRO en staat onder toezicht van de Amsterdam Economic Board. SNE zal samenwerken met o.a. Hogeschool van Amsterdam (HvA), Vrije Universiteit van Amsterdam (VU), SURFsara, GreenIT Amsterdam en commerciele bedrijven (SIG, Schuberg Philis en Equinix). Verscheidene Amsterdamse deelnemers zijn centrale spelers op het gebied van onderzoek en het valideren van nieuwe ideeen die leiden tot groenere en duurzamere computing (in data centra). Met dit onderzoeksproject heeft de SNE groep de mogelijkheid de optimale integratie van software en virtuele infrastructuren voor groene ICT diensten te onderzoeken, en dit in werkelijke scenario's te valideren door de faciliteiten die in dit project beschikbaar zijn te gebruiken.
08 april 2013
Nikhef onderzoeker Tjonnie Li naar buitenland met Rubicon-subsidie ⇒
Twintig onderzoekers ontvingen onlangs van de Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek (NWO) een subsidie uit het Rubicon-programma. Met deze financiering krijgen pas gepromoveerde wetenschappers de kans onderzoekservaring op te doen bij internationaal vooraanstaande instituten in het buitenland. Onder de twintig onderzoekers bevindt zich ook een onderzoeker van Nikhef: Tjonnie Li. Li's onderzoek maakt het mogelijk met zwaartekrachtgolven het binnenste van neutronensterren te bestuderen. Neutronensterren, de meest massieve sterren in het universum, zijn ideale laboratoria voor fundamentele fysica. Onze kennis van zulke sterren is echter beperkt. Onderzoekers stellen voor zwaartekrachtstraling te gebruiken waarmee voor het eerst het inwendige van neutronensterren kan worden waargenomen. Met de Rubicon-financiering krijgt Li de kans om voor 24 maanden te werken aan het LIGO laboratorium van het California Institute of Technology.
04 april 2013
GEANT publiceert Open Call netwerkinnovatie ⇒
Maandag 1 april heeft GEANT een Open Call gepubliceerd. GEANT daagt partijen uit om met zelfstandig onderzoek bij te dragen aan de doelen van GN3plus. Hiervoor is 3,3 miljoen euro subsidie beschikbaar. Om deel te nemen aan de Open Call van het GN3plus programma kunnen partijen voorstellen indienen binnen achttien onderwerpen. Deze voorstellen voor onderzoek en ontwikkeling dienen zelfstandig bij te dragen aan de doelen van GN3plus of toegevoegde waarde te creeren door gebruik van (experimentele) GEANT infrastructuur. Er is in totaal 3,3 miljoen euro aan EC-subsidies beschikbaar. Deelnemers maken met hun voorstel kans op een EC-subsidie van 50 tot 75 procent van het voorgestelde projectbudget, volgens het principe van gedeelde kosten. De uitvoering van uw voorstel moet plaatsvinden tussen oktober 2013 en maart 2015. De deadline voor het insturen van uw voorstel is 29 mei 2013, 17:00 uur.
18 maart 2013
Twentse studenten scoren Norvig-prijs  ⇒
Peter Norvig, wetenschappelijk directeur van Google, heeft via een live videoverbinding de naar hemzelf vernoemde 'Norvig Web Data Science Award' uitgereikt aan drie studenten van de Universiteit Twente, aldus Rolf Zaal van de Automatisering Gids. De studenten deden mee aan de prijsvraag "Wat kun je doen met zes miljard webpagina's?" De winnaars, Lesley Wevers, Oliver Jundt en Wanno Drijfhout, volgen de master Computer Science van de Universiteit Twente. Ze bedachten een systeem waarbij woorden die vaak samen in een zin of artikel staan, worden gelinkt. Zo wordt het woord 'Microsoft' onder meer gekoppeld aan 'Office' en 'Windows'. Het woord 'Apple' krijgt onder meer de associaties: 'iPad' en 'iPhone' mee. Vervolgens kan het systeem vergelijkingen maken tussen 'Microsoft' en 'Apple'. Op de vraag 'wat heeft Microsoft dat Apple niet heeft?', antwoordt het systeem 'SQL'. En op de vraag 'wat heeft (Bill) Gates dat (Steve) Jobs niet heeft?' Geeft het systeem het antwoord 'Melinda', de vrouw van Bill Gates. Initiatiefnemers van de Norvig Web Data Science Award zijn de Amerikaanse stichting Common Crawl en het Nederlandse supercomputercentrum SURFsara. Common Crawl stelt een collectie van zes miljard webpagina's beschikbaar voor het bedrijfsleven, wetenschappers en studenten in Nederland. SURFsara biedt de machines aan om deze data mee te analyseren. Peter Norvig is computerwetenschapper en expert in kunstmatige intelligentie en online zoeken. Naast zijn werk als wetenschappelijk directeur bij Google doet Norvig onderzoek en onderwijs op Stanford University. Zijn online college "Introduction to Artificial Intelligence" werd gevolgd door meer dan 160.000 studenten uit 209 landen, aldus nog Rolf Zaal.
20 maart 2013
Prins Willem-Alexander brengt bezoek aan Collaboratorium →

Zijne Koninklijke Hoogheid de Prins van Oranje heeft een bezoek gebracht aan het Collaboratorium, een high-tech visualisatiefaciliteit bij SURFsara op Science Park Amsterdam. Het bezoek werd geinitieerd door ECP | Platform voor de Informatiesamenleving. De Prins is lid van de Raad van Advies van dit platform. Anwar Osseyran, directeur SURFsara, gaf een korte introductie over Science Park Amsterdam en de rol van SURFsara en de andere instituten op het gebied van hoogwaardige ICT voor de kenniseconomie en wetenschap. In het Collaboratorium kunnen onderzoekers uit de wetenschap en het bedrijfsleven onder meer hun data analyseren en visualiseren. Door de geavanceerde mogelijkheden voor interactie kunnen onderzoekers ter plekke bijvoorbeeld in direct contact staan met vakgenoten op afstand. Dit stimuleert multidisciplinaire (internationale) samenwerking. Op een multifunctionele video wall met HD-schermen, die fungeert als een enorme tablet, demonstreerden drie jonge onderzoekers afkomstig uit de wetenschap, het bedrijfsleven en overheid hun werk. De presentaties verduidelijkten hoe simulaties en datavisualisaties inzicht helpen te vergroten in 'Big Data'.

10 april 2013
AkzoNobel selecteert Oracle Talent Management Cloud Service voor zijn recruteringsbehoeften ⇒
AkzoNobel, een verf-en coatingsonderneming en een vooraanstaand producent van chemicalien voor speciale doeleinden, heeft gekozen voor Oracle Talent Management Recruiting Cloud Service om zijn wereldwijde wervingsinspanningen te ondersteunen. Als onderdeel van een strategisch talent management initiatief, zal AkzoNobel zijn huidige SAP wervingsoplossing vervangen door Oracle Talent Management Recruiting Cloud Service. Als deel van de Oracle Cloud, helpt Oracle Talent Management Recruiting Cloud Service bedrijven zoeken naar de beste talenten, en ze te beoordelen, opsporen en inhuren. Naast het automatiseren van het wervingsproces, levert Oracle Talent Management Recruiting Cloud Service inzichten om bedrijven te helpen voortdurend hun talentacquisitie efficientie en effectiviteit te verbeteren. Na evaluatie van verschillende cloud-gebaseerde oplossingen, selecteerde AkzoNobel Oracle omwille van zijn geintegreerde talentmanagement mogelijkheden. Oracle Consulting Services zal het ontplooien van de toepassing beheren.
15 april 2013
Beloningssysteem nodig voor stimuleren delen van onderzoeksdata  →
Een overzichtsrapport van Knowledge Exchange beschrijft hoe data metrics kunnen helpen bij het toegankelijk maken van onderzoeksgegevens. Het rapport 'The Value of Research Data - Metrics for datasets from a cultural and technical point of view' adviseert een bredere uitwisseling en publicatie van onderzoeksdata door wetenschappers. Om dit te stimuleren dient een beloningssysteem voor wetenschappers te worden ontwikkeld op basis van data metrics. Een ander belangrijk aspect is dat de kosten van de publicatie van gegevens omlaag moeten. Ook is het essentieel dat de negatieve houding van wetenschappers ten opzichte van het publiceren van hun gegevens verandert. Het rapport adviseert een standaard te ontwikkelen voor het opslaan, publiceren, identificeren en citeren van datasets. Het rapport is in opdracht van Knowledge Exchange opgesteld door onderzoekers Rodrigo Costas, Ingeborg Meijer en Paul Wouters. Zij zijn allen verbonden aan het Centre for Science and Technology Studies van de Universiteit Leiden.
16 april 2013
Gen-ruis aan en uit te zetten met DNA-sequentie →
UvA-onderzoekers hebben met collega’s uit Israel een manier gevonden waarop cellen de 'ruis' van belangrijke genen kunnen verminderen. Door middel van een paar simpele DNA-mutaties toonden ze aan dat een gen geactiveerd kan worden met weinig of juist veel 'ruis'. De resultaten zijn gepubliceerd in het toonaangevende online tijdschrift PLoS Biology. De ontdekking heeft niet alleen implicaties voor ons begrip over hoe een cel efficient kan functioneren in een uiterst variabele omgeving, maar ook hoe - voor therapeutische doeleinden - bestaande genen geoptimaliseerd of ontworpen kunnen worden, zodat deze voor ruis ongevoelig en daardoor robuust (cel kan functioneren in een uiterst variabele en onvoorspelbare omgeving) zijn.
18 april 2013
EGI Community Forum in Manchester kreeg 380 deelnemers over de vloer →
Het EGI Community Forum vond plaats van 8 tot en met 12 april 2013 in Manchester, UK en telde 380 inschrijvingen. Tijdens de openingssessie werden de Europese e-Infrastructuren besproken. Peter Coveney van UCL Londen pleitte voor Big Data zonder grenzen. In 2012 kwam er in dit verband in de UK een rapport met roadmap uit over de toekomstige e-Infrastructuur strategie ( https://www.gov.uk/government/publications/e-infrastructure-strategy-roadmap-for-development-of-advanced-computing-data-and-networks ). Begin dit jaar investeerde de UK 189 miljoen pond in Big Data als een van de acht grote veelbelovende technologieen en de UK zit ook in de nieuw opgerichte Research Data Alliance, aldus Coveney. Rond medische gegevens in Big Data infrastructuren is er echter nog heel wat werk te verrichten. Coveney vond ook dat EGI (HTC computing), EUDAT (Big Data) en PRACE (HPC) de handen in elkaar moeten slaan om een gezamenlijke Europese e-Infrastructuur op te bouwen, besloot Coveney.
Jobcorner
04 april 2013
Institut de Physique du Globe in Parijs is op zoek naar een R&D High Performance Computing Engineer ⇒

Het Institut de Physique du Globe in Parijs heeft een vacature met contract van 12 maanden voor een R&D software ingenieur gespecialiseerd in optimalisatie en high performance computing. De kandidaat heeft ervaring met software ontwikkeling onder Linux; numerische benadering van partiele differentiele vergelijkingen; parallelle wetenschappelijke programmering; Fortran, MPI en OpenMP talen en programmeeromgevingen. De taak van de kandidaat zal erin bestaan om een nieuw geomagnetisch data assimilatie tool gebaseerd op de PARODY code te optimaliseren om het te kunnen laten draaien op architecturen van duizenden cores, met name in het PRACE Europese kaderwerk. Het nettoloon bedraagt tussen 2200 en 2500 euro per maand. Het contract start in september 2013. Meer informatie en sollicitatie bij Alexandre Fournier van het AVSGeomag onderzoeksprogramma via fournier@ipgp.fr

© Nieuwsbrief