28 november 2013Sluit venster
Enlighten Your Research Global: Virtual Machine Images voor Life Science Research
Denver - Een van de vier prestigieuze "Enlighten Your Research Global" (EYR-global) awards werd verleend aan een idee ontwikkeld door een ELIXIR werkgroep voor het delen van virtuele machines via onderzoeks- en onderwijsnetwerken. Het concept, dat is ontwikkeld uit een ELIXIR proefproject, maakt het veel gemakkelijker voor wetenschappers in verschillende landen om betekenis te vinden in grote hoeveelheden biomedische data op een veilige manier, zoals 1000 Genomen, Genoom van Nederland, en GWAS / epidemiologische gegevens in het BBMRI biobank netwerk. De werkgroep is een samenwerkingsverband van instellingen die betrokken zijn bij de ICT-infrastructuur voor biomedisch onderzoek: het Universitair Medisch Centrum Groningen (Genomics Coordination Centre, UMCG), het Centrum voor Informatie Technologie - Rijksuniversiteit Groningen (CIT-RUG) en SURFsara Amsterdam, de Universiteit van Cambridge en het European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute (EBI), en CSC - IT Centrum voor Wetenschap, Finland. Life science en gezondheidsonderzoek worden versneld met dit Europese wereldwijde onderzoeksnetwerk waarin dynamische lichtpaden tot 10 gigabit/seconde geintegreerd zijn.

Software pijpleidingen die biomedische onderzoekers gebruiken om grote datasets, zoals het menselijk genoom, te analyseren zijn zeer complex en voortdurend in ontwikkeling. Omdat wetenschappers uit vele disciplines zijn geinteresseerd in het analyseren van dit soort gegevens, is er een toenemende vraag naar eenvoudige software-oplossingen die zowel updates en het beheer van grote datasets aanpakken.

Cloud computing is een voor de hand liggende uitweg om te zoeken naar opslagoplossingen en web-gebaseerde "virtuele machines" hebben stilaan lokaal geinstalleerde softwarepakketten vervangen. Op basis van deze technologische ontwikkelingen, hebben ELIXIR leden een federatieve cloud service gemaakt voor medische biologie, waarin verschillende cloud-diensten, zoals de Helix Nebula, gebruikt door CERN, EMBL , ESA en EGI, virtuele machines bieden die kunnen worden gebruikt om verschillende types data te bestuderen. CIT draagt met de HPC Target infrastructuur en SURFsara met de HPC Cloud faciliteit bij aan dit project, Beide zullen nauw samenwerken met onderzoekers in de ontwikkeling van de virtuele machine beelden.

De Enlighten Your Research Global award is een initiatief van vijf onderzoeksnetwerken: SURFnet (NL), Janet (UK), Funet (Finland), ESnet (USA) en Internet2 (USA). De prijs dekt de kosten van de bouw van de netwerkinfrastructuur en de operationele kosten van het project voor het gebruik van het netwerk gedurende het eerste jaar.
http://www.surfsara.nl
Sluit venster